HMM

廉价感情. 提交于 2020-01-28 19:15:13

1、什么是HMM?

1.1 马尔可夫过程

马尔可夫性质是一种很有效的简化模型的工具,只要你说某过程具有马尔可夫性质,就说明该过程无后效性,什么意思呢? 就是说下一刻的状态只和我这一刻的状态有关,和我之前的状态是没有关系的。

马尔可夫链的极限分布,就是马尔可夫链经过无限长时间的转移,达到的最终状态,这个状态之和转移矩阵有关,与初始状态无关。
 

1.2 隐马尔可夫模型(Hidden Markov Model,HMM)

它用来描述一个含有隐含未知参数的马尔可夫过程。其难点是从可观察的参数中确定该过程的隐含参数。然后利用这些参数来作进一步的分析,例如模式识别。
 
任何一个HMM都可以通过下列五元组来描述:
:param obs:观测序列
:param states:隐状态
:param start_p:初始概率(隐状态)
:param trans_p:转移概率(隐状态)
:param emit_p: 发射概率 (隐状态表现为显状态的概率)
 
HMM典型应用:
根据掷骰子的结果序列,求解最可能的掷骰子方法: 此HMM包含掷骰子方法的信息 (掷骰子和掷骰子结果之间的联系)
根据拿球的结果序列,求解最可能的拿球方法: 此HMM包含拿球方法的信息(如何拿球和拿球结果之间的联系) https://www.jianshu.com/p/c80ca0aa4213
根据小红的twitter行为信息,求解最可能的天气状况: 此HMM包含 twitter行为信息包含行为和天气联系的信息 (即行为和天气之间的关系) https://www.hankcs.com/nlp/hmm-and-segmentation-tagging-named-entity-recognition.html

 

一条DNA序列,可以通过HMM变换,找到他的原始序列; HMM变换包含其亲缘序列信息,即遗传信息; 所以这里用HMM则是使用了其遗传信息。

2、什么是PSSM?

https://blog.csdn.net/u010608296/article/details/100535141

PSSM 我觉得是使用了核算打分矩阵这里的信息,即transition比transerversion更容易,然后对变换进行数学变换,进行打分。

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