20200510文献速递
一 文献题目： Single-cell RNA-seq analysis of the brainstem of mutant SOD1 mice reveals perturbed cell types and pathways of amyotrophic lateral sclerosis. 不想看英文题目： SOD1突变小鼠脑干的单细胞RNA序列分析揭示了肌萎缩性侧索硬化的细胞类型和途径。 背景： 肌萎缩性侧索硬化症（ALS）的发病机制涉及多种细胞类型（例如星形胶质细胞和小胶质细胞），为了确定哪一种细胞类型影响ALS，使用单细胞RNA测序（scRNA-seq）方法进行鉴定。 杂志和影响因子： Neurobiol Dis（IF： 5.16） 样本量： 两只SOD1(G93A) 突变的转基因小鼠，以及两只年龄匹配的野生型小鼠。分别从突变型和野生型小鼠中分离出3199 和1894个细胞。 分析方法： 通过查找细胞簇内突变细胞和野生型细胞之间的差异表达基因（DEG），鉴定单细胞中ALS相关的基因。使用KEGG，Reactome，BIOCARTA和Gene Ontology数据库对差异表达基因进行注释。最后将已发表肌萎缩性侧索硬化症的GWAS文献和单细胞测序鉴定出来的差异表达基因进行重合，进一步确认可能与肌萎缩性侧索硬化症相关的基因 结论：