Physicoochemical|CG content|
NCBI 存在的问题: 数据用户的增长 软件开发受限 数据分析缺乏 有些传统束缚,仅用底层语言书写 Pangenome Open gene 是随菌株数量增大而增大的 gene , Closed gene 是随菌株数量增大而趋于平滑的 gene 。 Mategenomics and longevity ,例子:年轻人的粪便使得老年鱼活的时间更长 Genomics for precision medicine 研究碱基 GC content ,三个氢键比较稳定( S ) chargaff''s rule GC content 与何种生物特性有关。 比如与 Genome size 成正比。 Eg :复制后突变使得 CG content 变高,用于研究演化。 Eg :利用 CG content 正负找到复制起始位点。 Genetic codes : 因为先 RNA 后 DNA ,所以从 AU 开始。 GCN 中的 N 表四重简并位点。 由左上角开始起源, GCP1 、 GCP2 , GC-rich 、 AT-rich 。 根据 Physicoochemical 分析可知: 中间是 A 则是电极 中间是 C 则是疏水 中间是 G 则是复杂 Modeling sequencing analyse S=C ∪ G R=A ∪ T 连乘得到的密码子的 content ,在不同物种中比较