Apache Helix

AlphaFold证明人工智能可以解决基本的科学问题

本秂侑毒 提交于 2020-12-20 12:32:33
来源:IEEE电气电子工程师 Gif: DeepMind Two examples of protein targets in the free modelling category. 任何人工智能的成功实施都依赖于以正确的方式提出正确的问题。这就是英国人工智能公司DeepMind(Alphabet的子公司)在利用其神经网络解决生物学的重大挑战之一蛋白质折叠(protein-folding)问题时所取得的成就。它的神经网络被称为AlphaFold,能够根据蛋白质的氨基酸序列以前所未有的准确度预测蛋白质的三维结构。 AlphaFold在蛋白质结构预测的第14个临界评估(14th Critical Assessment of protein Structure Prediction,CASP14)中的预测对于大多数蛋白质来说都精确到一个原子的宽度之内。竞争包括盲目地预测蛋白质的结构,这些蛋白质是最近才被实验确定的,还有一些尚待确定。 蛋白质被称为生命的组成部分,由20种不同的氨基酸以不同的组合和序列组成。蛋白质的生物学功能与其三维结构密切相关。因此,对最终折叠形状的了解对于理解特定蛋白质是如何工作的至关重要,例如它们如何与其他生物分子相互作用,如何控制或调整,等等。欧洲生物信息学研究所(European Bioinformatics Institute)荣誉主任Janet M.

miRNA结合位点预测软件RNAhybrid的使用教程

痞子三分冷 提交于 2020-04-27 11:58:52
RNAhybrid的介绍 RNAhybrid是Behmsmeier M等基于miRNA和靶基因二聚体二级结构开发的miRNA靶基因预测软件。RNAhybrid预测算法禁止分子内、miRNA分子间及靶基因间形成二聚体,根据miRNA和靶基因间结合能探测最佳的靶位点。尽管随着靶基因序列长度增加,运算复杂度也相应增加,但RNAhybrid和其它RNA二级结构预测软件诸如mfold, RNAfold, RNAcofold和pairfold相比,仍具有明显的速度优势。此外,RNAhybrid允许用户自定义自由能阈值及p值,也允许用户设置杂交位点的偏向,如杂交位点必须包含miRNA 5’端2-7nt等。 1.RNAhybrid的下载与安装 1 wget https: // bibiserv.cebitec.uni-bielefeld.de/applications/rnahybrid/resources/downloads/RNAhybrid-2.1.2.tar.gz 2 tar -xzvf RNAhybrid- 2.1 . 2 . tar .gz 3 cd /path/to/ RNAhybrid- 2.1 . 2 4 ./ configure 5 sudo make #这里尽量使用管理员模式,不然容易出错 6 sudo make install 验证是否安装成功,可以输入which

2020年5种最佳Joomla框架(又名模板框架)

假如想象 提交于 2020-02-27 22:57:44
首先,让我透露一下Joomla框架和Joomla模板框架之间的关系,因为我们经常将两者混为一谈。Joomla框架是Joomla的核心引擎,模板框架用于加快Joomla定制网站的设计和开发。默认情况下,它们是完全不同的东西。 今天我们将来讨论构建基于Joomla的网站的5种最佳Joomla框架。 Gantry:真正的开源Joomla模板框架 Gantry Joomla框架是由RocketTheme制作基于Joomla的网站和模板的真正的开源框架。由于压缩CSS和JS文件,因此可以提供良好的速度和最佳性能。对于Gantry模板框架的每个级别的用户,该文档都是明确且详细的。 新版本的Gantry具有出色的前端和后端设计,包括每行无限制的项目,每节无限制的行,强大的粒子系统,轻松的小部件位置放置,使用简单的滑块调整项目大小的功能,使您可以自定义页面的布局甚至更多。而且,它具有灵活的布局和可视菜单编辑器,具有65个模块位置和960个网格系统。 特征 强大高效的布局管理器 快速轻巧 可视菜单编辑器 超级菜单支持 Ajax管理员 无限的撤消/重做 基于Twig的模板 SCSS / LESS支持 主题继承 复杂的内置字段 离画布面板 基于YAML的配置 Helix Ultimate:最受欢迎的Joomla模板框架 Helix Ultimate是一款明星产品