我在哔哩哔哩上干了什么?

℡╲_俬逩灬. 提交于 2021-01-16 05:57:00

公众号那个留言想看基因组选择视频的人,注意了,视频来了!

1. 我和bilibili的故事

刚来到公司,领导告诉我,哔哩哔哩是个好东西,抱着试试看的态度,我打开了界面,什么?二次元,漫画我只看过进击的巨人好不好,这种style完全不是我的菜。

不安利哔哩哔哩的领导不是好的数据分析师,有一天,我对领导讲,腾讯课堂有很多生信的视频,很好啊!领导看了我一眼,说哔哩哔哩上面很多啊,还有人直播写代码呢。然后直播也不是我的菜。

后来,我注册了一个账号,但是他们的平台,要答题才能成为会员,它们的题目太多了,最重要的是,我不会这些题目!!!

再后来,我领导拿起我的手机,让我下去玩滑板,领导把题目给我做好了,于是我就成了哔哩哔哩的会员。。。

写这么多,是因为拍领导马屁一定要拍到正地方,有一句话讲:如果你想表扬别人,一定要从细节着手。因此我写了上面的话,用来描述我拍马屁的套路。

2. 我在bilibili上干了什么?

我上传了一些视频,这些视频我认为是很不错的,但是国内看不了,是我从YouTube下载的,关于全基因组选择,关于多年多点育种值和遗传力计算,关于全基因组关联分析,关于农业试验设计,关于农业数据分析等等。具体如下:

2.1 全基因组选择

这里面有两个视频,英文的,有PPT,回头我会将数据和代码上传到公众号上。英文讲的也很清楚,可以练练听力,很不错喔。

2.2 全基因组选择

这里有TASSEL的使用方法,QTL定位,表型数据遗传力计算等等。

2.3 根据多年多点数据使用R语言计算遗传力和育种值

这个视频,影响力太大了,目前很多人做多年多点的数据时,都要参考他的R代码,原始的数据和代码我后期会上传到公众号上。视频分为三节,讲的非常详细。

2.4 混合线性模型介绍

这里面包括15个视频,讲解混合线性模型,必须要看有没有。

2.5 植物育种与田间试验设计

你想知道alpha-lattice怎么设计,数据如何分析?
你想了解增广试验设计的分析方法?
里面都包含,应有尽有,无所不有。

3. 自我吹捧

可以这样讲,我已经将网络上,关于混合线性模型,关于基因组选择,关于田间试验设计,关于育种值,遗传力,BLUP之计算的视频都汇总在我的哔哩哔哩上面了。

如果你觉得不错,不要吝惜发朋友圈和点好看,毕竟我的公众号是我的QQ空间,你们的一举一动都在老大哥的视线之下。。。

4. 地址在哪里?

1, 关注我的公众号

2,点击原文阅读即可链接到我的哔哩哔哩上,里面有列表介绍。

我正在考虑是否有必要将相关内容,录成中文视频,然后放在哔哩哔哩上,问题来了:成为网红的风口是否已经到来(严肃脸)?



生物统计:

主要包括试验设计,生物统计中的数据分析,育种中的数据分析,相关的文献解读。

1,用R语言生成增广试验设计

2,P-rep designs 文献解析及实现方法

3,RCBD和alpha-lattice试验效率比较

4,如何对增广试验数据进行分析

5,如何对数据进行汇总统计(R语言)

6,关于联合方差分析的讨论-1

7,农业统计分析系列1-软件包介绍

8,农业统计分析系列2-试验设计

9,Excel中的数据透视功能处理农业数据

10,进军机器学习--序言

11,  植物育种中全基因组选择是成熟的方法么?

12,  不同试验设计遗传力的计算方法

13,  农业大数据时代的几个案例

14,  农业试验中如何分析单因素方差分析

15,  P-rep designs 文献解析及实现方法

16,  文献阅读:林木中遗传参数评估

17,  育种4.0世代的到来个人应该准备什么

18,  农业试验设计中田间种植图的绘制方法




数量遗传:

主要是动物数量遗传,动物育种中应用比较广泛,无论是基于系谱的动物模型,近交系数,亲缘关系系数,配合力,育种值,还是单性状模型,重复力模型,多性状模型等相关知识。

1,R语言求解混合线性方程组(有系谱)

2,R语言混合线性模型包代码演示

3,DMU-遗传参数评估-学习笔记1

4,DMU-单性状动物模型-学习笔记2

5,DMU-单性状重复力模型-学习笔记3

6,DMU-多性状动物模型-学习笔记4

7,DMU-单性状母体效应-学习笔记5

8,DMU软件 语法高亮-学习笔记6

9,DMU从入门到放弃系列汇总

10, DMU遗传参数评估cookbook pdf

11,育种中一般和特殊配合力的计算方法

12,为什么要学习数量遗传学1--序言

13,2-数量遗传学课程介绍

14,3-数量遗传学课程介绍-R语言基础

15,4-数量遗传学课程介绍-R挖掘数据

16,利用系谱计算近交亲缘关系系数

17,单性状动物模型矩阵形式计算BLUP值

18,  文献阅读: ABLUP-GBLUP-SSGBLUP模拟数据比较

19,  文献阅读:林木中遗传参数评估

20,  遗传变异系数怎么计算

21,  测定日模型及随机模型介绍

22, Admixture使用说明文档cookbook




编程语言:

包括Python,R语言,Julia,Perl语言,Linux的Shell语言,主要是我平时学习时的一些笔记和总结。

1,R,Julia以及Python共享数据

2,Python生物统计---笔记1

3,Python学生物统计---笔记2

4,Python学生物统计---笔记3

5,Python学生物统计---数据导入笔记4

6,Python学生物统计---可视化---笔记5

7,Python学生物统计---T检验笔记6

8,Python学生物统计---方差分析笔记7

9,shiny学习笔记1---上传数据

10,shiny学习笔记2-下载数据

11,shiny学习笔记3--生成html报告

12,data.table学习笔记1

13,data.table学习笔记2

14,  R语言与独孤九剑以及Python与降龙十八掌

15,  snakemake 学习笔记1

16,  snakemake 学习笔记2

17,  远程访问服务器 jupyter的设置方法

18,  WOX 糙快猛的实现方法

19,  R语言中如何写入xlsx的不同sheet表格

20,  几种加快R语言运算的方法

21,  如何批量安装R语言包

22, 如何高效的在服务器和本地进行上传和下载文件

23, 如何优雅的使用markdown写博客



基因组选择:

育种数据分析中,表型选择,方差分析,混合线性模型的BLUP育种值是学科的枝干,MAS,GWAS是花苞, GS则是盛开的花朵,其依赖于常规的数量遗传理论,但青出于蓝而胜于蓝,具有光明的前景,由于GS的应用,分子育种的落地又大大提前了一步。现在GS在动物育种中,特别是牛,猪,鸡,羊中正在大规模落地,以后再玉米,水稻,小麦,大豆的应用也将落地。冬天来了,春天还会远么?这个章节有文献解析,SNP数据清洗,G矩阵及H矩阵构建,模拟数据,软件使用,理论介绍等等。


1,QMSim 基因组数据模拟软件-介绍

2,关于SNP在染色体上的分布图怎么做

3,GS中G矩阵和H矩阵构建时的计算效率

4,JWAS: 基于贝叶斯的GWAS和GS软件

5,多性状分析中FA Model的用法

6,如何构建G矩阵-基因组亲缘关系矩阵

7,基因型数据012及-1,0,1计算基因频率

8,rrBLUP和asreml-r计算GBLUP比较

9,全基因组选择介绍-1

10,全基因组选择介绍2:构建H矩阵

11,基因组选择技术在动物育种中的应用

12,plink格式转化为012的方法

13,  全基因组选择GS软件: MiXBLUP 2.1介绍

14,  基因组选择和SNP分析在ASREML-SA中的实现方法

15,  基因组选择分析软件调研

16, 软件介绍: BLUPF90的无敌和寂寞




放飞自我系列:

所谓放飞自我, 就是放飞自我系列. 

1,使用摇床通过微信运动进行市场推广

2,关于写长文有助于思考的感想

3,《大国宪制》读后感---题记

4,一只特立独行的猪

5,铭记: 首例基因编辑婴儿在中国诞生

6,月薪8000出租车司机给我上的一课

7,DMU从入门到放弃系列汇总

8,读龙场大悟--有感

9,学习方法论与花心大萝卜的博文

10,玉米育种理论在谈恋爱中的应用分析

11,学习编程, 我为什么建议你不要看视频

12,人际交往能力远比你想象的重要

13,从年终总结到买凶杀人

14,科学算命以及全基因组选择的讨论

15,如何科学的理解算命及深度思考

16,有公众号的少年不可欺

17,情人节--下雪的白色情人节

18,农学研究生的前途

19,奇文读后感:农学劝退论

20,奇文共赏:农学专业有多坑?

21,为什么搞数据分析的人要学学打麻将

22,  上士闻道

23,  我与红宝书《玉米数量遗传学》的故事

24,  我年薪百万的故事

25,  从读书到别人思想的跑马场

26, 反对996为什么是一场闹剧


本文分享自微信公众号 - 育种数据分析之放飞自我(R-breeding)。
如有侵权,请联系 support@oschina.cn 删除。
本文参与“OSC源创计划”,欢迎正在阅读的你也加入,一起分享。

标签
易学教程内所有资源均来自网络或用户发布的内容,如有违反法律规定的内容欢迎反馈
该文章没有解决你所遇到的问题?点击提问,说说你的问题,让更多的人一起探讨吧!