变异与基因表达 | variants and gene expression | coding | non-coding

杀马特。学长 韩版系。学妹 提交于 2019-12-03 05:16:29

variant和gene expression是生物信息中两个非常重要的核心站点(根据中心法则,还有表观、3D genome、isoform、蛋白),这也是两个最能被准确测量的维度,在Post-GWAS,它们两的关系是我们研究的重点。

 

显然variant主要分为两类:

  • coding
  • noncoding

这两大类的分析方法截然不同,coding主要直接影响了mRNA和蛋白;而noncoding,我们主要认知都是在调控上。

 

先看看文献(搜 coding variant and gene expression ):

The Post-GWAS Era: From Association to Function

Modified penetrance of coding variants by cis-regulatory variation contributes to disease risk

The influence of genetic variation on gene expression

The impact of rare variation on gene expression across tissues

 

马上深入探索~

 

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