基因表达

变异与基因表达 | variants and gene expression | coding | non-coding

杀马特。学长 韩版系。学妹 提交于 2019-12-03 05:16:29
variant和gene expression是生物信息中两个非常重要的核心站点(根据中心法则,还有表观、3D genome、isoform、蛋白),这也是两个最能被准确测量的维度,在Post-GWAS,它们两的关系是我们研究的重点。 显然variant主要分为两类: coding noncoding 这两大类的分析方法截然不同,coding主要直接影响了mRNA和蛋白;而noncoding,我们主要认知都是在调控上。 先看看文献(搜 coding variant and gene expression ): The Post-GWAS Era: From Association to Function Modified penetrance of coding variants by cis-regulatory variation contributes to disease risk The influence of genetic variation on gene expression The impact of rare variation on gene expression across tissues 马上深入探索~ 来源: https://www.cnblogs.com/leezx/p/11779620.html

基因表达半衰期 | mRNA Half-Life

匿名 (未验证) 提交于 2019-12-02 23:47:01
做单细胞RNA-seq分析,自然就能想到我们测到的其实是一个概率学的东西,就像女士品茶里的酵母的泊松分布一样。 真实的细胞里,一切都是连续的,从DNA到mRNA到蛋白,是有一个时间间隔的,每一个process也不是瞬间完成的,而是有一个周期,我们可以叫做半衰期。 看一篇文献先: Database for mRNA Half-Life of 19 977 Genes Obtained by DNA Microarray Analysis of Pluripotent and Differentiating Mouse Embryonic Stem Cells 可以肯定的是,基因表达半衰期的变化与某些发育和疾病有一定的联系。 待续~