dna复制

靶向药（顺铂）的作用原理： 　　　　　　1. 只对增殖中的细胞有效。对正常细胞无效。而，癌细胞是处于高度增殖中的细胞。　　 　　　　　　　　它作用于DNA的大弯GC上，让其复制终止。所以，顺铂只对处于复制中的DNA起作用。否则，DNA高度压缩，不暴露在外面，顺铂无法起作用。 　　　　　　2. 顺铂（pt）-》CPS-3-》DME1-》细胞凋亡。 　　　　　　　　　　　　　　CPS-3（capase3）是一种胞质中的蛋白酶，引起细胞凋亡的关键酶。 　　　　　　　　　　正常的细胞凋亡也是这个过程，只是pt刺激了这个细胞凋亡的过程。但是，pt刺激的细胞凋亡过程快，与正常细胞缓慢的凋亡过程不同。 　　　　　　 问题：顺铂治疗后细胞死亡导致的DNA降解、断裂，与正常细胞凋亡导致的DNA降解，有何不同呢？　 　 　　　　　　　　　曾经想做这个方面的课题，想看看打顺铂病人体内的断裂的DNA与正常细胞凋亡断裂的DNA有何不同。 来源： https://www.cnblogs.com/zypiner/p/12578994.html

ATAC-seq（Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing） 是2013年由斯坦福大学William J. Greenleaf和Howard Y. Chang实验室开发的用于研究染色质可及性（通常也理解为染色质的开放性）的方法， 原理是通过转座酶Tn5容易结合在开放染色质的特性，然后对Tn5酶捕获到的DNA序列进行测序。 真核生物的核DNA并不是裸露的，而是与组蛋白结合形成染色体的基本结构单位核小体，核小体再经逐步的压缩折叠最终形成染色体高级结构（如人的DNA链完整展开约2m长，经过这样的折叠就变成了纳米级至微米级的染色质结构而可以储存在小小的细胞核）。而DNA的复制转录是需要将DNA的紧密结构打开，从而允许一些调控因子结合（转录因子或其他调控因子）。这部分打开的染色质，就叫开放染色质，打开的染色质允许其他调控因子结合的特性称为染色质的可及性（chromatin accessibility）。因此，认为染色质的可及性与转录调控密切相关。 开放染色质的研究方法有ATAC-seq以及传统的DNase-Seq及FAIRE-seq等，ATAC-Seq由于所需细胞量少，实验简单，可以在全基因组范围内检测染色质的开放状态，目前已经成为研究染色质开放性的首选技术方法。 Nat

生物的东西必须要主动去了解，否则视野容易受到限制，尤其是分子生物学的核心技术。 The Complete Guide to PCR (How it Works, Primer Design, and Running Reactions) 目的：从DNA双链中扩增出感兴趣的区段，用于后续的研究。 原理：DNA结构，双螺旋，AT、GC配对；DNA双链在临界温度会解链，退火后又会恢复；引物，DNA复制的起点，之所以需要引物是因为在DNA合成中DNA聚合酶只能把新的核苷酸加到已有的DNA链上。 操作核心： wiki上很全面 1. 引物设计，会考虑GC含量，决定退火温度； 2. 变性、退火和延伸； PCR Applications―Top Seven Categories Gene expression Genotyping (detection) Cloning Mutagenesis Methylation analysis Sequencing Medical, forensic, and applied sciences 问题： 1.真核生物的组蛋白会影响PCR吗？ 2.为什么需要前后引物，前后引物是如何p出指定区段的？ 逆转录PCR，就是PCR的一个常规应用，我也跑过，见过庞大的机器，也是先设计引物，然后提cDNA，定量。 一条RNA链被逆转录成为互补DNA