conda

想提升mac开发效率的朋友，Macdown小编问精心准备的这篇文章不可错过，在本篇文章中为大家介绍的是mac开发配置技巧。 mac开发配置技巧 mac系统的权限问题 遇到MacOS sierra系统的/usr下各种root操作出现“Operation not permitted”的问题，关闭 Rootless即可。重启按住 Command+R，进入恢复模式，打开Terminal: csrutil disable 重启即可。如果要恢复默认： csrutil enable mac用户组 OS X 内置会有staff wheel admin这三种常见的用户组，分别介绍一下 staff : 所有创建用户都会属于这个用户组，提供最基本的对该用户目录~/(/User/)的rwx权限，其他的一般只有r或者rx权限。比如我建立一个用户叫做lizhuoli，那么我会在一个staff组里面，对/User/lizhuoli/*有rwx权限。 admin :默认创建的所有用户也会属于这个admin用户组，在它里面的用户可以通过 su 或者 sudo 切换到root用户，只要执行以后输入这个用户的密码即可，而不需要知道root密码。 wheel :唯一只拥有一个用户root，意思是root用户的专属用户组。 结论 苹果新系统的Rootless防止用户误操作

3 月，跳不动了？>>>   Miniconda 是一个 Anaconda 的轻量级替代,默认只包含了 python 和 conda,但是可以通过 pip 和 conda 来安装所需要的包,Anaconda图形化界面比较臃肿,命令行方式安装快捷使用方便,推荐使用Miniconda.   Miniconda 安装包可以到 https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/ 下载,打开链接拉到最下方,可见最新版本,这里截至到2020-03-26最新版本为Miniconda3-py38_4.8.2-Windows-x86_64.exe,本次安装以此为例.   1. 安装Miniconda,要点有三     ①安装到非系统盘无中文无空格的目录下,如: D:\ProgramFiles\Conda\miniconda3     ②选中使用Python3.8作为Miniconda默认环境,如下图所示:            ③这里不建议将环境变量添加到系统中,可以通过Miniconda提供的快捷方式打开命令行界面:          2. 配置国内镜像源 通过Miniconda命令行快捷方式打开,命令行后,执行以下命令 conda config --add channels http://mirrors.tuna.tsinghua

写在前面的话： 疫情的影响，一直没有开学，一家人老实在家待着，除了看看孩子之外就是学习一下新的东西了。 再啰嗦一下： 之前分析Rna-seq的流程忘得差不多了，近期感觉记笔记是个好习惯，于是开始记笔记。现学现卖，作为现学现卖的第一篇，今天就讲讲conda吧。 为什么用conda呢？ 是因为，之前接触conda简单就是为了安装软件用，别人怎么用我就怎么搞。我想了想，不能这么干，一直想学习一下。 为什么是今天说conda呢？ 是因为最近按了一款软件，hisat2，学习过生信的人都知道hisat2，这是一款比对软件，跟bwa不同这款软件是用来讲rna比对到基因组的软件。最近在网上报了一个学习班，转录组分析班，在这里就不说是哪个学习班了，免得说是打广告。培训班有培训班的好处，也有不好的地方，抽空写一篇杂文再叨叨一下。 我用的conda是4.8.2版本的，conda 安装hisat2的时候很顺利，但是在用软件的时候产生了一个错误， Traceback (most recent call last): File "/home/xpy/miniconda3/envs/genek/bin/hisat2_read_statistics.py", line 210, in <module> reads_stat(args.read_file, args.read_count) File "/home

1. windows 查看 cuda 版本: nvcc -V 2. conda 常用命令： 1） conda env list 可以列出当前存在的虚拟环境。你会看到环境的列表，而且你当前所在环境的旁边会有一个星号，即默认的环境。 2）conda list 查看安装了哪些包。 3）conda update conda 检查更新当前conda。 4)如果你不再使用某些环境，可以使用 conda env remove -n env_name 删除指定的环境（在这里 env_name 为环境名 ）。 5) 创建python虚拟环境。 使用 conda create -n your_env_name python=X.X（2.7、3.6等)命令创建python版本为X.X、名字为your_env_name的虚拟环境。your_env_name文件可以在Anaconda安装目录envs文件下找到。 6) 使用激活(或切换不同python版本)的虚拟环境。 打开命令行输入python --version （或 python -V）可以检查当前python的版本。 使用如下命令即可 激活你的虚拟环境(即将python的版本改变)。 Linux: source activate your_env_name(虚拟环境名称) Windows: activate your_env_name(虚拟环境名称)

　　首先说明，pip和conda命令并不全是一样的，且有些库只能使用pip安装，conda装不了，可以理解为conda支持的库是pip里面的一少部分（我碰到过conda可以装，pip没法装的情况，可能是anaconda仓库里的库刚好有这个，具体我也搞不清楚） pip命令 安装库： pip install 库名 pip install 库名=版本号 　　　　 pip install -i 国内镜像源 库名 离线安装库： 命令行进入文件路径，再pip install ......whl 　如 安装pygraphviz 卸载： pip uninstall 库名 列出已经安装的库： pip list 列出需要更新的库 ：pip list --outdated 升级库： pip install --upgrade 库名 升级pip ：pip install -U pip pip版本： pip -V python版本： pip -V conda命令 安装库： conda install 库名 更新库 ：conda update 库名 更新所有库 ： conda update --all 来源： https://www.cnblogs.com/ZhangStudy/p/12527521.html