Count frequency of of a value in each column AND row in R or linux

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I have a bunch of files that look like this:

0/0/0/0/0/0/0/0/0/0/0/0/0/0/0/0/0/0/0/0/0/0/0/0:211:209,1:209:7394:1:40 0/0/0/0/0/0/0/0/0/0/0/0/0/0/0/0/0/0/0/0/0


                      
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